Onimaru cuenta con un aliado excepcional, el famoso científico profesor Kanabo, quien le ayuda a mejorar las propiedades de la fortaleza y construir nuevas y mortíferas armas. . . Mientras tanto, Yaiba y los suyos emprenden la búsqueda por todo el país de unas misteriosas bolas mágicas, cada una de ellas con una propiedad específica, y que, una vez reunidas, le ayudarán a resucitar al legendario dragón rojo. . . Pero para ello tienen que enfrentarse a un monje, a un ninja, a una estrella de mar.
