Esta novela cierra la trilogía La Estirpe del Arrabal y está dedicada a los descendientes actuales de los desterrados de Córdoba que en el siglo IX fundaron el Emirato de Creta. Narra la historia de la familia Karimás, sucesora de unos supervivientes del exterminio llevado a cabo por Bizancio al reconquistar la isla en el 961 d.C., el clan de los fabricantes de seda, eslabones de la misma cadena.
La familia actual también ha sufrido persecución en los siglos XX y XXI por parte de quienes se sienten herederos de Bizancio: nacionalistas de Grecia, cloacas del Estado griego, servicios de inteligencia, extrema derecha
Esa persecución se manifestó en sabotajes a sus negocios ya que eran los más poderosos y ricos de la isla, en acoso legal con denuncias falsas, amenazas, secuestros, tortura, etc. Y todo ello por descender de los cordobeses del emirato cretense, por reconocerlo públicamente, preservar su identidad y denunciar la tergiversación que aún se sigue haciendo de esos hechos históricos de su pasado medieval.
Geórgios Karimás, el protagonista, defiende en estas páginas:
Conocer la Historia de nuestros antepasados nos ayudará a conocernos mejor, a afianzar nuestra identidad, al paso que les hacemos justicia y contribuimos a que no sigan sepultados. Es como decirle de nuevo a Bizancio, a Grecia: ? ¡Yo soy uno de ellos! ¡Seguimos aquí!
La novela El águila en la tormenta, basada en hechos reales, es tan histórica como las dos que la precedieron en la trilogía La Estirpe del Arrabal, afirma Carmen Panadero Delgado, su autora, que lo es también de novelas como La Cruz y la Media Luna, El Collar de Aljófar, El hijo converso de Jaime I o La Horca y el Péndulo.